Цель исследовательской деятельности- это способствовать развитию области исследований сельской архитектуры в целом, обеспечить основу для архитектурной истории сельского архитектурного наследия, т.е. его создания и использования, а также внести вклад в познание экспонатов, находящихся в коллекциях. Эти знания будут использованы для создания экспозиций в сотрудничестве с другими отделами музея, для пополнения постоянной коллекции и для организации мероприятий по живой истории. В результате этих исследований мы узнаем все больше и больше о нашей истории, обеспечиваем достоверность предоставляемой нами информации и заглядываем в будущее.
Помимо исследовательской деятельности, миссия Эстонского музея под открытым небом заключается в содействии развитию сферы сельского наследия за пределами музея. Для продвижения исследований в области архитектуры хуторов, истории культуры, технологий сохранения наследия и защиты его ценностей в университетах, университетах прикладных наук и других учреждениях мы организовали ряд мероприятий (включая семинар "Quo vadis, наследие?", студенческую конференцию "Новая жизнь старой деревни" и День исследований, который знакомит с работой музея в этой области), мы курируем студенческие проекты, приглашаем практикантов и тесно сотрудничаем с учебными заведениями. Мы открыты для совместных исследовательских проектов с университетами и другими партнерами.
Исследования Эстонского музея под открытым небом основаны на исследовательской стратегии.